在我国，生态农业发展源远流长，稻田养鱼、桑基鱼塘等模式已有上千年历史，至今仍兴盛不衰。20世纪80年代初，国家有关部门提出了发展生态农业的总体思路。经过30多年的发展，全国开展生态农业建设的县已达300多个，其中国家级生态农业试点示范县102个，省级试点示范县200多个，遍布全国30个省、自治区、直辖市。
对于现阶段的中国而言，生态农业应当是现代化的生态农业，是生态农业与现代农业的复合体系，既不能只重视生态效益而忽视了投入产出，也不可以生态环境为牺牲换取经济效益。总之，中国生态农业的发展将是一个长久的艰巨的工程。
学界公认首次提出“生态农业”一词的是美国土壤学家 Ablerche，他于1970年提出这一概念。在我国，“生态农业”的概念是1982年在宁夏银川召开的全国生态经济学术研讨会上提出来的。
上世纪80年代，我国农业发展面临着一系列的严峻挑战，为了应对社会对农副产品日益增长的需求、进一步提高农业经济效益和进一步优化改善自然资源枯竭以及生态环境日益恶化的情况，我国对传统农业发展模式进行了反思，寻求一种符合我国国情的农业发展道路。
业内专家认为生态农业是作为一种现代化的农业发展模式，是在传统农业智慧的基础上，利用现代生态学原理和科学技术提升的一类环境友好型农业模式，在每一个环节上的物种不仅是受益方也是供给方，最终获得较高的社会效益、经济效益和生态效益。
从政策角度来看，今年的中央一号文中涉及生态农业的提法有多处，具有代表性的提法是：“推进农业供给侧结构性改革，加快转变农业发展方式，保持农业稳定发展和农民持续增收，走产出高效、产品安全、资源节约、环境友好的农业现代化道路，推动新型城镇化与新农村建设双轮驱动、互促共进，让广大农民平等参与现代化进程、共同分享现代化成果。”
“产品安全，环境友好”的农业，非生态农业莫属。尽管这里的提法依然用了农业现代化的老路子，但农业现代化不一定就是设施农业、规模农业，也不是转基因农业，只有生态农业才能够实现元素循环、环境友好。如利用生态平衡的办法可以实现少打农药甚至不打农药实现虫害控制，这一点已被国内外大量科学实验所证明。